优缺比一比：
 

　　1.    蛋白负染色试剂盒
 

　　缺点：需搭配黑底容器以便观察
 

　　优点：
 

　　(1)   特殊原理：负染原理，染剂只染胶体，不结合蛋白
 

　　(2)   快速染色：染色过程只需 5 分钟，不需要醋酸固定
 

　　(3)   高灵敏度：超高染色灵敏度 < 1 ng
 

　　(4)   实验相容：染色过后可进行蛋白质转渍或、电泳溶离、质谱仪蛋白质鉴定与转译后修饰分析。
 

　　(5)   安全可靠：染液不具毒性且可室温储存
 

　　(6)   方便观察：肉眼可见影像，不须荧光
 

　　2.    SYPRO Ruby
 

　　优点：灵敏度高
 

　　缺点：
 

　　(1)   操作过程需要全程避光
 

　　(2)   须长时间过夜染色
 

　　(3)   操作过程需搭配有机溶剂
 

　　(4)   需搭配价格高昂之荧光扫描机会 CCD 影像撷取系统取得影像
 

　　3.    硝酸银染色
 

　　优点：
 

　　(1)   染色灵敏度高达 1ng。
 

　　(2)   肉眼可立即观察染色结果。
 

　　缺点：
 

　　(1)   染色步骤复杂且耗时，新手较难驾驭，并且无法重新染色。
 

　　(2)   因银离子难以去除，即使使用改良版的质谱仪兼容之硝酸银染色法搭配后续质谱分析，依旧难以成功分析蛋白样品。
 

　　4.    CBR-250 (Coomassie Brilliant Blue R-250)
 

　　优点：容易取得，价格较低。
 

　　缺点：
 

　　(1)  灵敏度不高，仅 50 ng。
 

　　(2)  操作时间长达 2 小时至隔夜。
 

　　(3)  操作过程需搭配有机溶剂，长期使用将对使用者造成健康风险。