Ion S5是NGS高通量测序平台，它的核心技术是使用半导体技术在化学和数字信息之间建立直接的联系。在半导体芯片的微孔中的微球上固定DNA链，随后依次掺入ACGT。随着每个碱基的掺入，释放出氢离子，在它们穿过每个孔底部时能被检测到，通过对H+ 的检测，实时判读碱基。

Ion S5系统的特点：

· 测序速度：Ion S5采用直接检测H+的测序原理，具有快速的检测速度；

· 经济的测序成本：Ion S5测序无需酶联反应，无需荧光修饰的核酸，使其单轮测序成本经济，并且保证更高的测序准确度；

· 灵活度：Ion S5有三种通量的芯片可选，通量覆盖了从600Mb～15Gb的数据范围，适合不同通量的测序需求，灵活的选择方案可有效控制测序成本；

· 扩展性：由于采用半导体测序技术，Ion 将随着半导体技术的发展而进一步提升性能。

配合SGS的物种（动物、植物和鱼类）鉴定数据库，可显现未知物种的快速检测，为市场上的掺假行为提供检测手段。