临床分析是AA应用的重要组成部分，与环境分析具有一定的相似性。典型样品包括生物流体，如全血、血浆、血清和尿液，也包括硬、软组织，如骨骼、指甲、头发。涉及日常饮食营养学研究意味着还需要分析粪便。样品的准备技术通常很重要，特别是当使用石墨炉时。