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全自动液液萃取仪在水质检测的应用包括：

1. 环境监测：环境监测是水质检测中的一个重要方面，全自动液液萃取仪可用于检测水中的重金属、有机物等有害物质，确保水体的安全和健康。
2. 饮用水质量：全自动液液萃取仪可以用于检测饮用水中的有毒有害物质，如农药残留、有机物、微生物等，以确保饮用水的安全和健康。
3. 水质标准：全自动液液萃取仪可以用于评估水质标准，为水质管理提供科学依据。

此外，全自动液液萃取仪还可以应用于食品、医药、农药等领域的水质检测，以确保这些领域产品的安全和健康。在使用全自动液液萃取仪时，应注意选择合适的萃取溶剂和萃取时间，以确保萃取效果。同时，操作人员应严格遵守操作规程，确保安全和卫生。