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多光子显微技术出色的活体成像能力让很多针对活体动物的实验得以进行。经常地，与动物连接的实验设备不能兼容空间相对局限的显微镜。此外，当生物体俯卧时，感兴趣的区域可能难以进一步被处理。如果动物在清醒情况下，有可能会在整个实验过程中不断运动，那么以上提及的情形将会更加复杂。

Thorlabs公司的B-Scope显微镜为上述复杂的实验条件提供了特殊的解决方案。该显微镜是基于我们多光子成像系统的成像技术进行构建的，我们在该显微镜上增加了Z轴方向10英寸（254毫米）的粗略调节，消除了传统显微镜*的空间局限性，使得显微物镜以下具有充裕的空间。一些实验要求显微镜成像平面能够发生旋转，为此，该显微镜的整个光学系统能够沿着物镜焦点附近的圆弧进行旋转。这种旋转机制具有很大的优势，圆弧切面，即成像平面，能在不影响其它轴向的情况下进行旋转，保证了Z轴方向的聚焦调节总是与成像平面垂直。B-Scope还能够通过一个光学编码的闭环反馈系统进行X、Y、Z方向（X和Y方向上2英寸，Z方向上1英寸）和旋转角Θ（±50°）的精细调节。