氨基柱的键合基质分为硅胶基质、聚合物基质等，其中硅胶基质应用较为广泛，其特点主要包括以下3方面：

　　(1)低pH值，硅胶键合键容易水解(pH<2)；高pH值，硅胶容易溶解(pH>8)。

　　(2)在接近中性的条件时，硅醇基裸露，显酸性，不适宜分离碱性化合物。

　　(3)某些硅胶被一定金属污染，这些金属会引起峰的不对称或拖尾，甚至化合物的死吸附。

　　氨基柱的硅胶基质可分为全多孔硅胶微粒、杂化硅胶颗粒和实心核硅胶颗粒。

　　聚合物氨基柱装填有固定相用以分离混合组分的柱管。多为金属或玻璃制作。有直管形、盘管形、U形管等形状。氨基柱可分为填充柱和开管柱两大类。液相色谱通常均采用填充柱。氨基柱的分离效果取决于所选择的固定相，以及氨基柱的制备和操作条件。