高效液相色谱仪与气相色谱仪的进样方式、流动相、流动相与样品的作用、流动相粘度、流动相流动压力、固定相粒度、柱温、样品回收和应用范围等技术指标的差别如下：
 

　　一、进样方式：
 

　　1、高效液相色谱仪：样品制成溶液。
 

　　2、气相色谱仪：样品需加热气化或裂解且不分解。
 

　　二、流动相：
 

　　1、高效液相色谱仪：可选用不同性质的各种溶剂。
 

　　2、气相色谱仪：惰性气体。
 

　　三、流动相与样品的作用：
 

　　1、高效液相色谱仪： 可发生作用，能改善分离选择性。
 

　　2、气相色谱仪：不发生作用。
 

　　四、流动相粘度：
 

　　1、高效液相色谱仪：10ˉ3Pa·S
 

　　2、气相色谱仪：10ˉ5Pa·S
 

　　五、流动相流动压力：
 

　　1、高效液相色谱仪：2～20MPa
 

　　2、气相色谱仪：1～0.5MPa
 

　　六、固定相粒度：
 

　　1、高效液相色谱仪：5～10um
 

　　2、气相色谱仪：0.1～0.5mm
 

　　七、柱温：
 

　　1、高效液相色谱仪：常温
 

　　2、气相色谱仪：常温～300℃
 

　　八、样品回收：
 

　　1、高效液相色谱仪：容易且可定量，适合大量制备。
 

　　2、气相色谱仪：困难。
 

　　九、应用范围：
 

　　1、高效液相色谱仪：沸点高、极性强、稳定性差、分子量大的化合物和离子化合物。
 

　　2、气相色谱仪：稳定性好和易气化的化合物。