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如何应对细胞株系开发数据挑战

时间:2020-10-24      阅读:1610

细胞株开发是众多具有重大数据挑战的工作流程之一。与任何筛选过程一样,样本通量带来了数据量的挑战。当使用多种分析工具以不同格式生成不同类型的数据时,这就变得更加具有挑战性。这不仅需要在不同的孔板和孔之间移动数据,而且整个过程可能会延长数月。在整个过程中,必须对数据进行追踪,以确保进入生产的任何细胞株都有必要的历史数据(例如单克隆性的证明),并且为了报告需要,所有的数据都可以被方便地访问。在这里,我们将描述在Biomek i7工作站上自动化细胞株开发如何克服与此工作流程相关的许多数据挑战。

Biomek i7工作站与三方设备整合一起被用于自动化细胞株开发工作流程。

作为液体转移步骤的一部分,Biomek软件会自动移动数据,因此数据可以随着样本移动而并行移动(图4)。同时,数据也可以存储在DART数据库中,未来任何时候扫描孔板条码时,相应的数据都会被自动检索出来。DART提供了不同时间交互的方法之间的链接(图4)——在诸如细胞株开发这样的长时间工作流程中,这是一个关键组件。

图3:自动化数据处理示意图。

除开存储和利用数据,DART数据库可以通过多种方便的方式访问。为了以用户友好的方式进行快速可视化,可通过Chrome浏览器直接实时查看(图6A),同时可以使用DART报告生成器在Excel中生成报告。

图6:DART数据查看和报告。

在任何实验中产生的数据使实验有价值。数据处理中的任何错误都可能消除这个价值,甚至可能将研究进程推向错误的方向。对于像细胞株开发这样长达数月的工作流程,数据丢失或错误的风险更大,因此,确保数据完整性的工具至关重要。Biomek和DART软件通过使数据完整性过程自动化且易于获取,可以为细胞株开发过程提供真正的价值。

想要了解更多关于数据处理方面的内容,请访问贝克曼库尔特生命科学部

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