【应用笔记】如何利用内参进行定量分析
时间:2020-11-10 阅读:596
各位实验室工作者们大家好~应用笔记的小编又和大家见面啦。*已经过去一周了,不知道各位的快递是否还在路上呢?(笑)
虽然不能帮大家催下马爸爸,但是这周小编为大家带来了内参的知识,包括为什么,是什么,怎么做三部曲,具体内容大家请下滑:
Western Blot为什么必须要用内参?
检测一个基因的表达产物是否正确,或者比较表达产物量的相对变化,方法是Western Blot,因为Western Blot操作相对简单方便,既可以定性分析表达产物,同时还可以指示目的蛋白量的相对变化。但是,要用Western Blot比较不同条件下或者不同组织中,目的蛋白表达量的相对多少,前提条件是等量的细胞上样,才有比较的基础。特别是当表达量不高时,上样量的差别就很可能影响结果的分析。所以你需要内参。
在国外发表的文章中,WesternBlotting 实验结果须进行内参校正已成为一种惯例。但是,国内仍有不少科研人员在Western Blotting实验中忽略了内参的使用,将蛋白浓度测定作为规范需相互比较的各种样品间上样量等同的方法。然而各种蛋白质浓度定量方法,都存在局限性,不能*准确的确定各种样品的准确蛋白浓度。如UV法直接定量,适合测试较纯净、成分相对单一的蛋白质,相对于比色法来说,操作简单,但是容易受到平行物质的干扰,如DNA的干扰;且敏感度低,要求蛋白的浓度较高。比色法测定蛋白浓度一般有BCA,Bradford,Lowry 等几种方法。BCA法与Lowry法都容易受到蛋白质之间以及去污剂的干扰。Bradford 法敏感度,且与一系列干扰Lowry,BCA 反应的还原剂(如DTT,巯基乙醇)相容。但是对于去污剂依然是敏感的,其主要的缺点是不同的标准品会导致同一样品的结果差异较大,无可比性。另外,蛋白质定量以后进行电泳时需要等量上样,此步骤也存在操作误差。因此在Western blotting实验时使用内参,即可简便地对定量和上样步骤产生的误差进行校正。
What is内参?
内参即是内部参照(Internal Control),对于哺乳动物细胞表达来说一般是指由管家基因编码表达的蛋白(HousekeepingProteins),它们在各组织和细胞中的表达相对恒定,在检测蛋白的表达水平变化时常用它来做参照物。
小编列了一些常用的内参蛋白及使用注意事项,可供大家参考。
内参蛋白 | 样品类型 | 分子量(kDa) | 注意事项 |
GAPDH | 全细胞/胞质内参 | 30-40 | 不适合核提取物 |
β-actin | 全细胞/胞质内参 | 43 | 不适合与氧相关的研究 |
α-tubulin | 全细胞/胞质内参 | 55 | 不适合涉及年龄差异较大的受试者的研究 |
Lamin B1 | 核内参 | 68 | 不适合胚胎干细胞 |
COX IV | 线粒体内参 | 16 | 不适合15-17 kDa蛋白 |
Transferrin | 血清内参 | 79 | 转铁蛋白水平可能受某些疾病状态和治疗影响 |
Histone H3 | 核内参 | 15 | 不适合15-17 kDa蛋白 |
如何利用内参进行定量分析
实验结果分析其实很简单:如果样品蛋白量有限,只够进行一次电泳转膜实验时,分别检测样品的内参量和目的蛋白量。将各样品目的蛋白量分别除以其内参含量,得到的数值即为内参校正后的各样品中目的蛋白相对含量,再用此数值进行样品间的比较和分析,得到目的蛋白含量在不同样品间的实际变化结果(如下图)。如果样品量充分,可以先检测内参,观测样品间内参显色条带是否一致,根据差异大小调整各样品的上样量重新进行Western Blotting实验,至内参量一致为止;若内参一致,即可进行不同样品间目的蛋白表达变化分析。这样虽然麻烦一点,但是可以保证结果更有说服力,更可信。毕竟我们的实验是一种严谨的工作。
经过小编本次科普大家是否对内参的了解更加深入了呢?更多关于内参的调节请见下次分享。
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