制药行业水处理利用微生物，主要是细菌的代谢作用，氧化、分解、吸附废水中可溶性的有机物及部分不溶性有机物，并使其转化为无害的稳定物质从而使水得到净化的技术。在现代的生物技术处理过程中，主要有好氧生物氧化、兼氧生物降解及厌氧消化降解被广泛应用。通过对污水产生过程分析确定此污水成分，研究污水中各组分的性质和特点，转变治理思路，创新的提出了蒸发分离综合利用的处理方案，确定首先将污水中的低沸点物质先蒸出，车间回用。剩下的污水含有大量的无机盐，采用继续蒸馏，蒸出水返回车间作为工艺水回用，无机盐回收。
 

　　物料进入三效、二效、一效进行蒸发结晶，使得废水达到设计浓度时出料，浓缩液去自然沉淀(人工定期清理)，物料冷凝液去生产工序中回用或者进入生化系统进行处理，蒸汽冷凝液为软化水可直接去锅炉作为补给水，回收的低沸点有机物返回生产工序中回用。让比重较小的杂质浮于水面捞出，或是比重较大的杂质沉淀于下，进而取得。化学方法则是利用各种化学药品将水中杂质转化为对人体伤害较小的物质，或是将杂质集中，历史zui久的化学处理方法应该可以算是用明矾加入水中，水中杂质集合后，体积变大，便可用过滤法，将杂质去除。制药行业水处理时通过在原水中添加新的成分，通过物理或化学反应后来获得所需要的水质，对原水的加工不涉及去除杂质或添加新成分的问题。